1. مركز مجدى يعقوب للقلب بأسوان:
زيارة ا.د. مجدى يعقوب لمستشفى أمراض وجراحات القلب والصدر بمسشتفيات جامعة عين شمس فى شهر يوليو 2017 لتوطيد العلاقات مع المراكز الطبية المتخصصة لتدريب مختلف الكوادر من الأطباء بمختلف التخصصات والتمريض والصيادلة والمهندسين على التقنيات الحديثة فى علاج أمراض قلب الأطفال لمدة من 6-12 شهر على التوالى وتم الإعلان عن بداية التعاون وأهم الأهداف فى مؤتمر صحفى بالمستشفيات
2. إدارة الحرب الكيميائية بوزارة الدفاع في مجال التدريب والتعليم والبحث العلمى
3. المعامل المركزية وبنك الدم بالخدمات الطبية بوزارة الدفاع للتعاون فى مجال التحاليل الطبية وبنوك الدم
4. مستشفى وادى النيل:
يهدف التعاون الى جمع جهود الطرفين وتنشيط التعاون العلمي والبحثى والتدريب ورعاية المرضي، وتوسيع الخبرات وتعزيز المعرفة والتفاهم بين كلية الطب ومستشفيات جامعة عين شمس ومستشفي وادي النيل فى مختلف التخصصات مثل أعضاء هيئة تدريس والهيئة المعاونة والأطباء والتمريض والفنيين من مختلف التخصصات مثل المعامل والأشعة وتكنولوجيا المعلومات والمهندسين والإداريين
5. تحيا مصر:
التعاون لعمل مسح للكشف عن فيروس سى وعمل حملات توعية ضد فيروس سى داخل المستشفيات وخارجها للمجتمع المدنى خلال 2017. وذلك عن طريق تدريب المدربين لتكوين شبكة مدربين لتوعية مختلف فئات الشعب المصرى للوقاية ومنع انتشار الفيروسات الكبدية فى جميع المحافظات
6. وزارة الصحة المصرية:
استقبال وتدريب ( 10 أطباء ) فى مجال الرعاية العاجلة بوزارة الصحة والسكان داخل مستشفيات جامعة عين شمس وتوفير أماكن مناسبة لإقامتهم بسكن الأطباء
بروتوكول تعاون مع مديرية الشئون الصحية بالبحر الأحمر لتوفير أطباء والمدرسين والاساتذة المساعدين للعمل بمستشفيات البحر الأحمر
7. مؤسسة المصريين للإنماء الإقتصادى (مؤسسة خالد عبد الله):
(أ) مساهمة المؤسسة فى تكلفة عمليات زرع القوقعة بالأذن وعمليات زرع القرنية
(ب) مساهمة أعضاء هيئة التدريس بكلية الطب جامعة عين شمس لتقديم الخدمة الطبية بالمركز الطبى الخاص بالمؤسسة لخدمة حى عين شمس
8. الجمعية الطبية المصرية – المملكة المتحدة وجمعية الجود الخيرية:
لبناء القدرات والقيادات والتعليم والتدريب والتطوير الطبى المستمر من خلال دعم إستقدام الأساتذة والإستشاريين المصريين المقيمين بإنجلترا وإرسال الأطباء الشباب إلى إنجلترا للتدريب وزيادة الخبرات
9. هيئة التدريب الإلزامى التابعة لمجلس الوزراء لتدريب الأطباء (البورد المصرى):
تتولى كلية الطب جامعة عين شمس تدريب أطباء البورد المصرى بالتخصصات التالية:
مهارات الإتصال Communication skills
مكافحة العدوى
10. بيت الزكاة والصدقات المصرى:
لمساعدة المرضى الغير قادرين على تلقى العلاج والمساهمة فى تكاليف العلاج والعمليات بالمستشفيات بالأخص عمليات العظام والمفاصل وعلاج بعض أمراض دم الأطفال
11. بنك الشفاء:
لمساعدة المرضى الغير قادرين على تلقى العلاج والمساهمة فى تكاليف العلاج والعمليات والأدوية وتدبير المستلزمات اللازمة لبعض الأقسام